硅胶基质液相色谱柱的填料基质硅胶采用自家生产的B型高纯度硅胶，其生产方式采用典型的堆砌珠法（聚合诱导胶体聚集法）。通过在硅溶胶分散体系中的聚合反应，将纳米级硅溶胶包结成有机-无机复合微球，烧结除去有机物后得到全多孔硅胶微球。
硅胶基质液相色谱柱的选择方法：
1、确定分离目的确定你的应用是否要求高分离度、短分析时间、高灵敏度、长柱寿命，低的实验成本等。
2、评估分析物的化学性质评估分析物的化学性质。。诸如化学结构、溶解性、稳定性等。
3、选择合适的色谱柱了解色谱填料的物理和化学性质。
硅胶基质液相色谱柱使用过程中压力升高的原因：
如果压力升高，一种可能是烧结滤片被堵塞，这时应更换滤片或将其取出进行清洗；另一种可能是大分子进入柱内，使柱头被污染；
如果柱效降低或色谱峰变形，则可能柱头出现塌陷，死体积增大。
在后两种情况发生时，小心拧开柱接头，用洁净小钢将柱头填料取出（注意把被污染填料取净）再把柱内填料整平。然后用适当溶剂湿润的固定相（与柱内相同）填满色谱柱，压平，再拧紧柱接头。这样处理后柱效能得到改善，但是很难恢复到新柱的水平。
柱子失效通常是柱端部分，在分析柱前装一根与分析柱相同固定相的短柱，可以起到保护、延长柱寿命的作用。采用保护柱会损失一定的柱效，这是值得的。
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